Données sur le microbiome des étoiles de mer issues du séquençage d'amplicons 16S associé à des sites intertidaux rocheux des îles Calvert et Quadra

10.21966/0xvh-1318

Ce paquet de données contient des données de terrain et génomiques relatives au manuscrit « Schémas régionaux, saisonniers et liés aux maladies dégénératives dans les microbiomes dermiques de deux espèces d'étoiles de mer intertidales issues d'une série chronologique pluriannuelle ».

Dans le cadre des études intertidales rocheuses en cours sur les îles Calvert et Quadra, des échantillons de peau ont été prélevés pendant trois ans dans chaque région afin d'étudier plus en détail les microbiomes associés à deux espèces d'étoiles de mer : l'étoile ocre Pisaster ochraceus et l'étoile cuirée Dermasterias imbricata. Des échantillons d'eau de mer ont également été prélevés à proximité du site lors de chaque enquête afin d'examiner les communautés microbiennes de fond. L'ADN a été extrait d'échantillons d'écouvillons et d'eau de mer et la région V4 du gène de l'ARNr 16S a été ciblée pour le profilage de la communauté microbienne. Les données ont ensuite été analysées pour examiner les modèles des communautés microbiennes dans les différents types d'échantillons, régions, saisons et stades de la maladie débilitante chez P.ochraceus.

Cet ensemble de données fait partie du programme de recherche et de surveillance des zones littorales de l'Institut Hakai, conçu pour capturer les changements dans les habitats intertidaux rocheux. L'objectif principal de la recherche menée par Hakai Nearshore est d'étudier le rôle des habitats et de leurs communautés associées face au stress et aux perturbations provoqués par le changement climatique mondial et les perturbations côtières locales. La composante échantillonnage de l'ADN et traitement des données génomiques de l'ensemble de données fait partie du réseau d'observation biomoléculaire de l'Institut Hakai (HI-BON), un projet approuvé par la Décennie des Nations Unies pour les sciences océaniques au service du développement durable.

Ce paquet de données est accessible gratuitement à tous, conformément aux principes d'accès équitable et de partage des avantages. Cependant, nous attendons de tous les utilisateurs de données qu'ils attribuent les noms aux fournisseurs de données (lisez notre licence de données) et l'utilisation de ces données doit se faire dans le respect d'une utilisation équitable, c'est-à-dire : 1) respecter les fournisseurs de données et fournir des commentaires utiles sur la qualité des données, et 2) communiquer et/ou collaborer avec les fournisseurs si vous envisagez d'utiliser cet ensemble de données pour des manuscrits ou d'autres formes de reporting.

Accès et utilisation

Licence: Licence Creative Commons 4.0 Attribution

Données et ressources

Citation

Related Works

Mots clés

Étendue du jeu de données

Date(s) de référence des métadonnées April 24, 2026 (Publication)
October 16, 2026 (Revision)
Date(s) de référence des données February 09, 2020 (Création)
April 24, 2026 (Publication)
Fréquence de mise à jour Au besoin

Partie responsable 1
Nom
Prentice, Carolyn ORCID logo
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Courriel
carolyn.prentice@hakai.org
Rôle
  • Auteur
  • Dépositaire
  • Distributeur
  • Propriétaire
Partie responsable 2
Nom
Froese, Tyrel ORCID logo
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Courriel
tyrel.froese@hakai.org
Rôle
  • Dépositaire
  • Co-auteur
Partie responsable 3
Nom
Olson, Angeleen ORCID logo
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Rôle
Co-auteur
Partie responsable 4
Nom
Sadlier-Brown, Gillian
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Rôle
Co-auteur
Partie responsable 5
Nom
Pontier, Ondine ORCID logo
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Rôle
Co-auteur
Partie responsable 6
Nom
Monteith, Zachary ORCID logo
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Courriel
zach.monteith@hakai.org
Rôle
Co-auteur
Partie responsable 7
Nom
VanMaanen, Derek
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Rôle
Co-auteur
Partie responsable 8
Nom
Bachen, Krystal ORCID logo
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Rôle
Co-auteur
Partie responsable 9
Nom
Earle, Heather ORCID logo
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Rôle
Co-auteur
Partie responsable 10
Nom
Janusson, Carly ORCID logo
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Rôle
Co-auteur
Partie responsable 11
Nom
Clemente-Carvalho, Rute ORCID logo
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Rôle
  • Dépositaire
  • Co-auteur
Partie responsable 12
Nom
Gehman, Alyssa ORCID logo
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Rôle
  • Auteur
  • Dépositaire
  • Distributeur
  • Propriétaire
  • Chercheur principal
Partie responsable 13
Nom
Kellogg, Colleen ORCID logo
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Rôle
  • Auteur
  • Dépositaire
  • Distributeur
  • Propriétaire
  • Chercheur principal
Partie responsable 14
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Rôle
  • Distributeur
  • Propriétaire
  • Éditeur
Partie responsable 15
Affiliation
Tula Foundation ROR logo
Rôle
Fondateur

Champ Valeur
Variables océaniques
  • Biomasse et diversité microbienne
  • Abondance et distribution des invertébrés
Portée Jeu de données
Statut Terminé
Topic Category oceans
Note de maintenance Generated from https://hakaiinstitute.github.io/hakai-metadata-entry-form#/en/hakai/4TvAwNKXC7PkAi0TEZsZbbAzXfi1/-Oo1MBmr8fW1fputdBh6
Étendue spatiale { "coordinates": [ [ [ -128.3, 49.87 ], [ -124.8, 49.87 ], [ -124.8, 51.75 ], [ -128.3, 51.75 ], [ -128.3, 49.87 ] ] ], "type": "Polygon" }
Latitude limite Nord 51.75
Latitude limite Sud 49.87
Longitude limite Est -124.8
Longitude limite Ouest -128.3
Étendue temporelle
Début
2020-02-09
Fin
2023-11-28
Étendue verticale
Min
0
Max
0
Langue par défaut Anglais
Identifiant de citation
Code
https://doi.org/10.21966/0xvh-1318
Projects
  1. Nearshore
  2. Genomics
Included in Data Catalogue
Included in Data Catalogue 1
Nom
Hakai Data Catalogue
Description
Science on the Coastal Margin
URL
https://catalogue.hakai.org