Ce paquet de données fait partie du projet collaboratif Marna Wet Lab de l'Institut Hakai et du Martone Lab (Université de la Colombie-Britannique, UBC) qui étudie les effets environnementaux sur les algues coralliennes. Le programme de recherche expérimentale Marna Wet Lab de l'Institut Hakai utilise des expériences de laboratoire pour évaluer les réponses des organismes marins à des conditions environnementales océaniques simulées actuelles et futures. L'objectif principal de la recherche expérimentale du Hakai Wet Lab est d'étudier les mécanismes de vulnérabilité et de résilience de diverses espèces et communautés marines dans des conditions environnementales futures statiques ou dynamiques, et de comprendre comment les organismes réagissent phénotypiquement, physiologiquement et/ou génomiquement au stress thermique et à l'acidification.
Les algues corallines constituent un groupe diversifié d'algues rouges calcifiantes qui peuplent un large éventail d'environnements marins dans le monde entier où elles fournissent un soutien structurel aux récifs, créent un habitat et des ressources alimentaires pour les invertébrés et soutiennent la biodiversité en favorisant le recrutement de larves et de varech. L'une des caractéristiques uniques de ce groupe d'algues rouges est qu'elles déposent du carbonate de calcium dans leurs parois cellulaires végétatives, créant ainsi une structure de thalle rigide essentielle au soutien et à l'habitat. Bien que la calcification soit un processus clé pour la physiologie et l'écologie des algues coralliennes, on en sait peu sur les mécanismes moléculaires, physiologiques et cellulaires qui la soutiennent et sur la manière dont ceux-ci peuvent être affectés par les changements climatiques. Des travaux sur d'autres espèces tropicales d'algues coralliennes ont toutefois suggéré que les algues calcifiantes pourraient être particulièrement sensibles au stress thermique et à l'acidification, bien que les réponses des espèces tempérées soient largement sous-étudiées.
Des travaux sont en cours dans le laboratoire du Dr Patrick Martone pour identifier des gènes de calcification putatifs à l'aide de transcriptomes spécifiques aux tissus (calcifiés ou non calcifiés) (RNASeq) chez l'algue coralline articulée, Calliarthron tuberculosis. L'objectif de ce travail est de comprendre les fondements moléculaires du mécanisme de calcification en mettant en évidence les principaux gènes de calcification et en développant des amorces qPCR spécifiques aux gènes pour étudier l'expression des gènes. Sur la base de ces travaux fondamentaux, nous proposons d'explorer les effets interactifs du pH et de la température sur une population de Calvert de Calliarthron en nous concentrant sur la calcification, l'expression génique, la croissance et les réponses physiologiques au stress par le biais d'une expérience en mésocosme de plusieurs semaines.
Ce paquet de données comprend une partie des données de cette expérience concernant la température du mésocosme et la chimie des carbonates et les protocoles associés, le traitement et l'analyse de ces données collectées par l'équipe du Marna Wet Lab. Des données expérimentales supplémentaires sont détenues par nos collaborateurs Emma Jourdain et Patrick Martone (UBC).
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10.21966/7nwn-bj60
