Données pour article : Les différences de détection entre l'ADNe et les chaluts semi-aquatiques sont déterminées par la biomasse des poissons et les préférences en matière d'habitat

Les relevés scientifiques marins au chalut sont couramment utilisés pour évaluer la distribution et la taille de la population des espèces liées à la pêche, mais cette méthode demande beaucoup d'efforts et peut être destructrice pour l'environnement. Le séquençage de l'ADN environnemental (ADNe) à partir d'échantillons d'eau peut révéler la présence d'organismes dans une communauté sans les capturer ; toutefois, nous nous attendons à ce que la détectabilité des taxons diffère entre les études d'ADNe et celles réalisées au chalut, et comprendre comment les caractéristiques des espèces et les variables démographiques contribuent aux différences de détection peut nous aider à calibrer nos attentes pour chaque forme d'échantillonnage. Ici, nous avons couplé le métabarcodage à barres de l'ADNe et des relevés de capture au chalut en Colombie-Britannique, au Canada, afin d'examiner les caractéristiques des espèces qui expliquent les différences récurrentes de détectabilité entre les deux méthodes, notamment l'habitat, la taille corporelle et la biomasse. À l'échelle régionale, 17 des 23 espèces de poissons (74 %) capturées par le chalut ont été détectées par méta-codage à barres de l'ADNe, et 39 autres espèces ont été détectées uniquement par échantillonnage de l'ADNe. Nous avons constaté que le métabarcodage de l'ADNe détectait de manière disproportionnée les espèces capturées au chalut présentant une plus grande biomasse locale (c'est-à-dire une plus grande biomasse dans le chalut adjacent). Les poissons détectés uniquement dans l'ADNe présentaient une plus grande gamme de longueurs corporelles et une plus grande gamme de préférences en matière d'habitat en dehors de la taille cible des chaluts et des zones d'échantillonnage. Nos résultats suggèrent que, compte tenu de notre niveau d'échantillonnage, le méta-codage à barres de l'ADNe peut récapituler de manière adéquate la détection des communautés de poissons détectées lors des relevés au chalut, mais avec un biais en faveur des poissons dont la biomasse démographique est élevée et une plus grande inclusion de poissons provenant de l'extérieur de la zone chalutée.